我和我丈夫结婚几年了，已有两个孩子了，因感情不合，已分居六年了，我想离婚，请问该…

你们双方可以先自行协商解决，如果你们双方无法就抚养权达成一致，那么通常来说两周岁以下的孩子法院一般判决随母亲生活。
两周岁到十周岁的孩子人民法院会根据有利于孩子成长的原则结合父母亲的实际情况，例如父母的工作时间、经济收入情况、住房条件、与孩子相处的时间、家人能否帮忙一起照顾小孩、学历等具体情况进行判决。
十周岁以上的孩子法院会考虑孩子自身的意愿，孩子愿意与谁共同生活就判决给谁。
如果你们有两个孩子，那么法院通常是让父母双方一人抚养一个；